Pidnarulex (CX-5461)

目录号：S2684 批次号：S268404

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化学数据

化学结构式 别名 N/A 储存条件
(自收到货起)		 3年 / -20°C / 粉状
1年 / -80°C / 溶于溶剂
化学式

C27H27N7O2S
分子量 513.61 CAS号 1138549-36-6
Solubility (25°C)* 体外 DMF (warmed with 50ºC water bath) 2 mg/mL (3.89 mM)
DMSO Insoluble
Water Insoluble
体内（现配现用）
澄清溶液
5%DMF 95%Corn oil
2mg/ml (3.89mM) 以 1 mL 工作液为例，取50μL40mg/ml的澄清 DMF 储备液加到950μL玉米油中，混合均匀。工作液请现配现用！
* <1 mg/ml means slightly soluble or insoluble.
* Please note that Selleck tests the solubility of all compounds in-house, and the actual solubility may differ slightly from published values. This is normal and is due to slight batch-to-batch variations.

制备储备液

生物活性

产品描述 Pidnarulex (CX-5461)是一种rRNA synthesis抑制剂，选择性抑制Pol I驱动的rRNA转录，在HCT-116，A375，和 MIA PaCa-2细胞中IC50为142 nM，对Pol II没有作用，对rRNA转录的抑制比对DNA复制和蛋白翻译的抑制选择性高250到300倍。
靶点
Pol I-driven transcription of rRNA [1]
(HCT-116, A375, MIA PaCa-2 cells)
142 nM
体外研究

CX-5461能够选择性抑制HCT-116细胞中rRNA合成(Pol I IC50=142 nM；Pol II IC50 > 25 μM；选择性约200倍)。CX-5461对rRNA合成的选择性抑制在两种其他人类实体肿瘤细胞系，黑色素瘤 A375 (Pol I IC50 = 113 nM；Pol II IC50 > 25 μM)和胰腺癌MIA PaCa-2 (Pol I IC50=54 nM；Pol II IC50 ~25 mM)中得到证实。CX-5461对rRNA转录抑制作用的选择性是对DNA复制和蛋白质翻译的250~300倍。CX-5461对一组人类癌细胞系表现出光谱抗增殖活性，但是对非转化的人类细胞的作用活性很小。所有测试细胞系的中值EC50为147 nM，所有正常细胞系的EC50值大约为5, 000 nM。对HCT-116，A375，和MIA PaCa-2细胞系的抗增殖剂量响应评估的得到的EC50值分别为167，58，和74 nM。CX-5461通过p53-不依赖过程，诱导固体肿瘤细胞自吞噬或衰老，但不诱导细胞凋亡。[1]
体内研究

异种移植人固体肿瘤的小鼠模型中，CX-5461口服生物可利用，且在体内具有抗肿瘤活性。CX-5461显示出显著的MIA PaCa-2 TGI，在第31天，TGI 为69%。同样的，CX-5461表现出显著的A375 TGI，第32天的TGI为79%。[1]

推荐的实验操作(此推荐来自于公开的文献所以Selleck并不保证其有效性)

激酶实验 Pol I 和 Pol II 转录活性检测
两个寿命短暂的RNA转录物(半衰期~20-30 分钟)，一个由聚合酶I产生，另一个由聚合酶II产生，通过qRT-PCR定量，作为CX-546对转录的相关作用的测量。45S前体rRNA作为聚合酶I转录物，原癌基因c-myc作为聚合酶II转录物的对比。聚合酶I和聚合酶II转录物均会被通常的细胞应激影响。为最小化应激作用的潜在影响，将细胞在测试试剂下仅暴露很短的时间(2 小时)。如果CX-5461影响它们的合成，暴露的时间足以使这些转录物减少90%以上。
细胞实验 细胞系 一组癌细胞和正常细胞系
浓度 0-2 μM
处理时间 96小时
方法

将细胞接种在96孔板，第二天用剂量响应的CX-5461处理96小时。细胞活性使用Alamar Blue 和CyQUANT试验测定。
动物实验 动物模型 5×106 MIA Paca-2 和 A375 癌细胞皮下注射到5-6周大雌性无胸腺小鼠的右侧面
剂量 50 mg/kg
给药处理 CX-5461通过口服给药，每天一次或每3天一次。

客户使用selleck产品的实验数据

数据来源于[Data independently produced by PLoS One, 2014, 9(8), e104364]

数据来源于[Data independently produced by , , Cell, 2018, 174(2):338-349]

数据来源于[Data independently produced by , , Oncogene, 2015, 10.1038/onc.2015.147]

数据来源于[Data independently produced by , , J Control Release, 2018, 286:1-9]

Pidnarulex (CX-5461)在文献中得到引用

Nucleolar stress caused by arginine-rich peptides triggers a ribosomopathy and accelerates aging in mice [ Mol Cell, 2024, 84(8):1527-1540.e7] PubMed: 38521064
An RNA damage response network mediates the lethality of 5-FU in colorectal cancer [ Cell Rep Med, 2024, 5(10):101778] PubMed: 39378883
VAV2 orchestrates the interplay between regenerative proliferation and ribogenesis in both keratinocytes and oral squamous cell carcinoma [ Sci Rep, 2024, 14(1):4060] PubMed: 38374399
Alcohol exposure suppresses ribosome biogenesis and causes nucleolar stress in cranial neural crest cells [ PLoS One, 2024, 19(6):e0304557] PubMed: 38941348
Integrated drug response prediction models pinpoint repurposed drugs with effectiveness against rhabdomyosarcoma [ PLoS One, 2024, 19(1):e0295629] PubMed: 38277404
Systematic Evaluation of Benchmark G4 Probes and G4 Clinical Drugs using three Biophysical Methods: A Guideline to Evaluate Rapidly G4-Binding Affinity [ Chembiochem, 2024, e202400210] PubMed: 38619969
CX‑5461 potentiates imatinib‑induced apoptosis in K562 cells by stimulating KIF1B expression [ Exp Ther Med, 2024, 27(3):107] PubMed: 38356673
CX‑5461 potentiates imatinib‑induced apoptosis in K562 cells by stimulating KIF1B expression [ Exp Ther Med, 2024, 27(3):107.] PubMed: 38356673
USP36 stabilizes nucleolar Snail1 to promote ribosome biogenesis and cancer cell survival upon ribotoxic stress [ Nat Commun, 2023, 14(1):6473] PubMed: 37833415
USP36 stabilizes nucleolar Snail1 to promote ribosome biogenesis and cancer cell survival upon ribotoxic stress [ Nat Commun, 2023, 14(1):6473] PubMed: 37833415

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