DDX6 Antibody (Rabbit mAb) [J2G17]
目录号: F8033
抗体应用：
反应性：
-
Lane 1: RAW 264.7, Lane 2: PC-12, Lane 3: NIH/3T3, Lane 4: C2C12
使用信息
| 稀释比例 |
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| 抗体应用 |
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| WB, IP, IHC, IF |
| 反应性 |
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| Human, Mouse, Rat |
| 抗体类型 |
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| Rabbit Monoclonal Antibody |
| 储存液配方 |
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| PBS, pH 7.2+50% Glycerol+0.05% BSA+0.01% NaN3 |
| 储存条件(自收到货起) |
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| -20°C (avoid freeze-thaw cycles), 2 years |
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预测分子量
实际分子量
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54 kDa
54 kDa
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| *为什么预测分子量和实际分子量会有不同？ 以下原因可能会导致蛋白分子量与预测不同：翻译后修饰（磷酸化/糖基化）；剪接变体和异构体；相对电荷；多聚体。 |
| 阳性对照 | Human liver tissue; Human tonsil tissue; Rat spleen tissue; Mouse spleen tissue; HAP1 cells; HeLa cells; RAW 264.7 cells; PC-12 cells; NIH/3T3 cells; C2C12 cells |
|---|---|
| 阴性对照 |
实验方法
| WB |
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实验步骤： 样品制备
1. 组织样品：破碎组织，加入适量冰冷的 RIPA/NP-40 Lysis Buffer （含蛋白酶抑制剂Cocktail），低温匀浆或置于冰上超声裂解样品，静置30 min。 2. 贴壁细胞样品：吸去培养基, 用冰冷的 PBS 清洗细胞 2 遍。加入适量冰冷的 RIPA/NP-40 Lysis Buffer （含蛋白酶抑制剂Cocktail），超声处理以裂解细胞，并在冰上孵育 30 分钟。 3. 悬浮细胞样品：将培养基转移至离心管中离心，弃上清，用冰冷的 PBS 清洗细胞 2 遍。加入适量冰冷的 RIPA/NP-40 Lysis Buffer （含蛋白酶抑制剂Cocktail），超声处理以裂解细胞，并在冰上孵育 30 分钟。 4. 将所得匀浆液/裂解液置于离心机中 4°C 离心 15 min，收集上清液；
5. 取少量裂解液测定蛋白质浓度；
6. 加入蛋白上样缓冲液，将 20 µL样品在 95~100°C加热 5 min，冰上静置冷却后离心 5 min。
电泳分离
1. 根据所提蛋白的浓度，将适量蛋白样品和 Marker 上样至 SDS-PAGE 凝胶。建议分离胶（即下层胶）浓度：10 %。 SDS-PAGE 分离胶浓度选择参照表 2. 电源调 80 V, 30 min。然后电源调 110 V~150 V，观察 Marker，待蛋白所在的预染蛋白 Marker 指示带得到合适的分离后，即可停止电泳。（注意电泳时电流切勿过大，如超过 150 mA 会导致温度上升，容易影响跑胶结果。如无法避免采用大电流，可对电泳槽使用冰浴降温。）
转膜
1.拿出电转槽，把夹子和耗材浸泡在预冷电转液中；
2.用甲醇活化 PVDF 膜 1 min，用转移缓冲液冲洗；
3.按照“夹子黑边-海绵-滤纸-滤纸-胶-PVDF膜-滤纸-滤纸-海绵-夹子白边”的顺序安装好； 4.将蛋白电转移至 PVDF膜上。（推荐采用 0.45 µm PVDF 膜） PVDF 膜孔径规格选择参照表 湿转法参考条件：200 mA, 120 min。
（注意电转条件可根据蛋白大小适当调节，分子量大的蛋白适宜采用大电流，并延长转膜时间，但需要确保电转槽始终处于低温的环境中，避免凝胶融化。）
封闭
1. 电转移后，室温下用 TBST 洗膜 5 min；
2. 在封闭液中将膜孵育 1 h，室温；
3. 用 TBST 洗膜 3 次，每次 5 min。
抗体孵育 1. 用 一抗稀释液配制一抗工作液（建议一抗稀释比 1:1000），4°C 条件下与膜轻柔摇晃孵育过夜； 2. 用 TBST 洗膜 3 次，每次 5 min；
3. 在封闭液中加入二抗，室温条件下与膜轻柔摇晃孵育 1 h；
4. 孵育结束后，用 TBST 洗膜 3 次，每次 5 min。
显色
1. 加入配制好的 ECL 发光底物（或根据二抗选择其他显色基质）混合均匀；
2. 与膜孵育1 min，去除多余底物（需保持膜湿润），置于显影仪中进行曝光。
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| IF |
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实验步骤：
样品准备
1. 贴壁细胞：取洁净无菌盖玻片置于培养皿中，待细胞接近长成单层后取出盖玻片。
2. 悬浮细胞：将细胞接种至多聚赖氨酸包被的洁净无菌载玻片上。
3. 冰冻切片：将玻片置于室温下解冻，纯水或 PBS 摇洗 3次，每次 3 min。
4. 石蜡切片：先将玻片脱蜡至水，纯水或 PBS 摇洗 3次，每次 3 min。然后进行抗原修复。
固定
1. 使用固定液，如4%多聚甲醛（4% PFA）室温固定细胞爬片/涂片或组织切片 10~15 min。
2. 使用 PBS 摇洗样品 3次，每次 3 min。
通透
1. 对样品添加去垢剂，如 0.1~0.3% Triton X-100，室温通透 10~20 min。
（仅针对胞内抗原，若是细胞膜上表达的抗原则可省略该步骤。）
2. 使用 PBS 摇洗样品 3次，每次 3 min。
封闭
添加封闭液，在室温下封闭至少 1 h。（常用的封闭液包括：与二抗同一来源的血清、BSA或山羊血清。）
注意事项：从封闭开始之后的所有步骤务必保证样品湿润，避免干燥，否则极易产生高背景。
免疫荧光染色（第一天）
1. 吸走封闭液，滴加稀释后的一抗。
2. 湿盒中 4°C 孵育过夜。
免疫荧光染色（第二天）
1. 吸走一抗，PBST 摇洗 3 次，每次 5 min。
2. 滴加稀释后的荧光二抗，避光 4°C 孵育 1~2 h。
3. 吸走二抗，PBST 摇洗 3 次，每次 5 min。
4. 滴加稀释后的 DAPI，室温避光 孵育 5~10 min。
5. PBST 中摇洗 3 次，每次 5 分钟。
封片
1. 抗荧光淬灭封片剂封片。
2. 干燥玻片，将玻片置于室温下避光过夜。
3. 将载玻片放入玻片盒中 4°C 避光保存。
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| IHC |
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实验步骤：
脱蜡/补液
1. 脱蜡/水合切片：
2. 将切片在二甲苯中孵育 3 次，每次 5 分钟。
3. 将切片在 100% 乙醇中孵育两次，每次 10 分钟。
4. 将切片在 95% 乙醇洗涤液中孵育两次，每次 10 分钟。
5. 用 dH2O 清洗切片两次，每次 5 分钟。
6.抗原修复：对于柠檬酸盐：将载玻片浸入 1X 柠檬酸盐暴露溶液中，在微波炉中加热，直至开始沸腾； 在亚沸温度 (95°-98°C) 下继续煮 10 分钟。 在工作台上冷却玻片 30 分钟。
染色
1. 用 dH2O 清洗切片 3 次，每次 5 分钟。
2. 将切片在 3% 过氧化氢中孵育 10 分钟。
3. 用 dH2O 清洗切片两次，每次 5 分钟。
4. 在洗涤缓冲液中洗涤切片 5 分钟。
5. 用 100–400 µl 封闭液在室温下封闭每个切片 1 小时。
6. 除去封闭液，并向每个切片中添加 100–400 µl 一抗稀释液。 4°C 孵育过夜。
7. 去除抗体溶液，用洗涤缓冲液洗涤切片 3 次，每次 5 分钟。
8. 用 1-3 滴所需的 HRPA 覆盖切片。 在加湿室中室温孵育 30 分钟。
9. 用洗涤缓冲液洗涤切片 3 次，每次 5 分钟。
10. 使用前将 DAB 显色剂浓缩液加入 DAB 稀释液中并充分混合。
11. 在每个切片上涂抹 100–400 µl DAB 并密切监测。 1-10 分钟通常可提供可接受的染色强度。
12. 将载玻片浸入 dH2O 中。
13. 如果需要，用苏木精复染切片。
14. 用 dH2O 清洗切片两次，每次 5 分钟。
15. 切片脱水：95%乙醇孵育切片两次，每次 10 秒； 在 100% 乙醇中重复，孵育切片两次，每次 10 秒； 在二甲苯中重复，孵育切片两次，每次 10 秒。
16. 用盖玻片和封固剂封固切片。
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生物描述
| 特异性 |
|---|
| DDX6 Antibody (Rabbit mAb) [J2G17] 可检测内源性 DDX6 总蛋白水平。 |
| 蛋白定位 |
|---|
| 细胞质，细胞核 |
| Uniprot ID |
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| P26196 |
| 克隆号 |
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| J2G17 |
| 别名 |
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| HLR2, RCK, DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, ATP-dependent RNA helicase p54, DEAD box protein 6, Oncogene RCK |
| 背景 |
|---|
| DDX6，又称RCK或p54，是一种保守的DEAD-box RNA解旋酶，属于DDX6样亚家族，在真核细胞中作为胞质mRNA命运的核心调控因子发挥作用，主要定位于加工小体、应激颗粒以及人类细胞系中的离散核灶。该蛋白包含典型的解旋酶核心结构，其保守基序用于ATP结合、水解和RNA相互作用，两侧是低复杂度的N端和C端区域，这些区域为效应蛋白和衔接蛋白在不同mRNP复合物中的结合提供了对接位点。解旋酶核心结构与脱帽因子和5′–3′降解因子（如DCP1A、EDC3、EDC4、LSM14A和XRN1）相互作用，这种相互作用网络支持DDX6依赖性地将翻译抑制的mRNA募集到加工小体中，并协调其在脱腺苷酸化依赖性mRNA降解途径中的脱帽和降解。 DDX6 还与翻译抑制因子相互作用，包括 4E-T 和 CCR4-NOT 复合物，从而将帽结合蛋白交换、翻译沉默和去腺苷酸化偶联起来，使该解旋酶成为在活性多核糖体、储存颗粒和降解区室之间转移特定转录本的关键节点。DDX6 与 Argonaute 蛋白和 GW182 家族成员的结合使其与 microRNA 介导的基因沉默联系起来，它支持被抑制的 miRNA 靶标 mRNP 的组装及其向 P 小体的递送，从而将小 RNA 通路与 mRNA 的整体周转整合起来。在正常生长条件下，DDX6 在人类细胞中分布于弥散的胞质池和由与去帽因子共定位定义的特定 P 小体之间；而在应激条件下，它也会聚集在应激颗粒中，形成部分重叠但功能不同的 mRNP 凝聚体，这些凝聚体分离翻译沉默的 mRNA。该蛋白包含一个双元核定位信号和一个CRM1依赖的核输出序列，其核质分布响应这些信号的活性，从而允许其在细胞核和细胞质之间穿梭，并为核质mRNA处理平衡提供额外的调控机制。DDX6与包含PATL1、LSM14A和其他支架因子的复合物结合，这些复合物决定了DDX6主要参与翻译抑制、mRNA储存还是主动降解。不同的结合蛋白组合构成互斥的复合物，这些复合物占据不同的细胞质区域，并指导不同的转录结果。在哺乳动物祖细胞和干细胞中，DDX6参与转录后调控程序，通过影响编码信号组分和转录调控因子的mRNA的稳定性和翻译来调节增殖和分化之间的平衡。类似的作用也延伸至动物系统中发育mRNA群的调控。 DDX6 表达或复合物组成的失调出现在人类疾病中，包括癌症（其中解旋酶水平的改变与生长控制转录本表达的变化相关）以及神经系统或发育环境（其中 DDX6 依赖性颗粒动力学的扰动影响祖细胞功能和组织稳态）。 |
| 参考文献 |
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