UNC0638
UNC0638 是一种有效的选择性的组蛋白赖氨酸甲基转移酶（HMTase）抑制剂，作用于G9a和GLP，IC50分别为< 15 nM和19 nM，有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。UNC0638 具有抗病毒的活性。
UNC0638 Chemical Structure
CAS: 1255580-76-7
产品质控
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99.84%
99.84
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细胞实验数据示例
| 细胞系 | 实验类型 | 给药浓度 | 孵育时间 | 活性描述 | 文献信息 |
|---|---|---|---|---|---|
| H1299 cells | Function assay | 0.25 uM | 24 h | Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis | 21780790 |
| MDA-MB-231 cells | Function assay | 48 h | Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM | 22975593 | |
| 22Rv1 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM | 21780790 | ||
| PC3 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM | 21780790 | ||
| MCF7 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM | 21780790 | ||
| IMR90 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM | 21780790 | ||
| HCT116 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM | 21780790 | ||
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生物活性
| 产品描述 | UNC0638 是一种有效的选择性的组蛋白赖氨酸甲基转移酶（HMTase）抑制剂，作用于G9a和GLP，IC50分别为< 15 nM和19 nM，有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。UNC0638 具有抗病毒的活性。 | ||||
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| 靶点 |
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| 体外研究(In Vitro) | ||||
| 体外研究活性 | UNC0638是一种有效的，选择性的，可渗透细胞的G9a和GLP的化学探针，相比于BIX01294，毒性/功能比小于6，其毒性/功能比大于100。UNC0638是一种有效的G9a和GLP抑制剂，对广谱的表观遗传和非表观遗传靶点有选择性。UNC0638对SET7/9 (a H3K4 HMTase)，SET8 (a H4K20 HMTase)，PRMT3，以及SUV39H2有大于10,000倍的选择性。在MDA-MB-231细胞中，UNC0638 (48 h处理)以浓度依赖的方式降低H3K9me2水平，IC50 是81 nM。UNC0638处理各种细胞系导致较低的全局H3K9me2水平降低，这与用shRNA降低G9a和GLP观测到的效果是一致的。UNC0638显著降低MCF7细胞的克隆形成能力，降低G9a调控的內源基因的启动子区H3K9me2的丰度，同时影响microRNAs。在小鼠胚胎干细胞中，UNC0638以浓度依赖的方式重新激活G9a沉默的基因和一个报告基因，同时不促进分化。[1] | |||
|---|---|---|---|---|
| 激酶实验 | SAHH耦合试验 | |||
| 这个实验在腺苷脱氨酶的作用将腺苷转换为肌苷，利用SAHH分解甲基转移酶产生的S-腺苷高半胱氨酸，形成同型半胱氨酸和腺苷。同型半胱氨酸的浓度通过偶联荧光基团ThioGlo测定。IC50测定，反应缓冲液如下：25 mM 磷酸钾缓冲液pH 7.5，1 mM EDTA，2 mM MgCl2，含 5 μM SAHH 的0.01% Triton X 100，0.3 U/mL 腺苷脱氨酶，25 μM SAM，以及15 μM ThioGlo。G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3以及SUV39H2分别在25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM 和100 nM的浓度下测量。UNC0638以4 nM 到 16 μM的浓度加入缓冲液。孵育2分钟后，加入组蛋白多肽触发反应，G9a 中加入10 μM H3(1-25)，EHMT1中加入20 μM H3(1-25)，SETD7中加入100 μM H3(1-25) ，SETD8中加入500 μM H4(1-24)，PRMT3中加入10 μM H4(1-24) ，SUV39H2中加入200 μM H3K9Me1 (1-15)。在384孔板中，用Biotek Synergy2 plate reader在360/40 nm 感光片和528/20 nm滤光片下观测甲基化反应过程中荧光的变化，持续20分钟。扣除实验背景后，用Sigmaplot计算IC50。计算两组独立实验的标准差。 | ||||
| 细胞实验 | 细胞系 | MCF7, U2OS 和 H1299细胞 | ||
| 浓度 | 3 μM | |||
| 孵育时间 | 65 h | |||
| 方法 | 将约为5×105的细胞铺于75 cm2烧瓶中。MCF7和U2OS细胞培养于不含酚红、而包含Earl's salts、10% FBS、1 mM Pyruvate、2 mM Glutamine和1×非必需氨基酸的MEM培养基中。H1299细胞培养于含酚红和10% FBS、1×Anti-Anti的DMEM培养基中。向培养基中加入3 μM UNC638A或等体积DMSO。将烧瓶置于37℃/5% CO2培养箱中。65小时后，收集培养基、离心以移除其中细胞碎片。将10-15 mL培养基与HPLC级别的氯仿混合，轻轻摇晃，然后静置，知道有机层和水层分离开来。收集有机相，用无水Na2SO4进行干燥，然后真空中收集浓缩。剩余残渣溶于100 μL 甲醇，进行后续分析。 |
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| 体内研究(In Vivo) | ||
| 体内研究活性 | 在小鼠中进行的药物代谢和药代动力学研究表明，UNC0638经静脉注射、腹腔注射或口服途径给药，在体内清除率高、半衰期短、高体积分布和低暴露量[1]。 | |
|---|---|---|
| 动物实验 | Animal Models | Swiss albino mice |
| Dosages | IV, 1 mg/kg; PO, 3 mg/kg; IP, 2.5 mg/kg | |
| Administration | i.v./i.p./oral | |
化学信息&溶解度
| 分子量 | 509.73 | 分子式 | C30H47N5O2 |
| CAS号 | 1255580-76-7 | SDF | Download UNC0638 SDF |
| Smiles | CC(C)N1CCC(CC1)NC2=NC(=NC3=CC(=C(C=C32)OC)OCCCN4CCCC4)C5CCCCC5 | ||
| 储存条件(自收到货起) | |||
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体外溶解度 |
DMSO : 100 mg/mL ( (196.18 mM) ；DMSO吸湿会降低化合物溶解度，请使用新开封DMSO) Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
摩尔浓度计算器 |
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体内溶解度 现配现用，请按从左到右的顺序依次添加，澄清后再加入下一溶剂 |
动物体内配方计算器 | ||||
实验计算
动物体内配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
mg/kg
g
μL
只
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶于水的药物；不同批次药物配方比例不同，请联系Selleck为您提供正确的澄清溶液配方）
% DMSO
%
% Tween 80
% ddH2O
%DMSO
%
计算结果：
工作液浓度： mg/ml；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于μL DMSO溶液（母液浓度mg/mL，注：如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请先联系Selleck）；
体内配方配制方法：取μL DMSO母液，加入μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入μL ddH2O，混匀澄清。
体内配方配制方法：取μL DMSO母液，加入μL Corn oil，混匀澄清。
注意：1. 首先保证母液是澄清的；
2.一定要按照顺序依次将溶剂加入，进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液，可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。
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