Pracinostat (SB939)
Pracinostat (SB939) 是一种有效的pan-HDAC抑制剂，IC50为40-140 nM，除了HDAC6例外，对III型同工酶SIRT I没有抑制活性。Pracinostat (SB939) induces apoptosis in tumor cells。Phase 2。
Pracinostat (SB939) Chemical Structure
CAS: 929016-96-6
产品质控
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相关信号通路图
细胞实验数据示例
| 细胞系 | 实验类型 | 给药浓度 | 孵育时间 | 活性描述 | 文献信息 |
|---|---|---|---|---|---|
| MDA-MB-435 cells | Proliferation assay | 48 h | Antiproliferative activity against human MDA-MB-435 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.48 μM | 24119555 | |
| HCT116 cells | Proliferation assay | 48 h | Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.24 μM | 24119555 | |
| NCI-H460 cells | Proliferation assay | 48 h | Antiproliferative activity against human NCI-H460 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.22 μM | 24119555 | |
| MCF7 cells | Proliferation assay | 48 h | Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.17 μM | 24119555 | |
| OVCAR5 cells | Proliferation assay | 48 h | Antiproliferative activity against human OVCAR5 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.61 μM | 24119555 | |
| HepG2 | Antiplasmodial assay | 53 hrs | Antiplasmodial activity against exoerythrocytic-stage of Plasmodium berghei ANKA infected in human HepG2 cells after 53 hrs by DAPI staining-based method, IC50 = 0.15 μM. | 28241112 | |
| Sf9 | Function assay | 2 hrs | Inhibition of recombinant human HDAC-2 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. | ChEMBL | |
| HEK293-F | Function assay | 2 hrs | Inhibition of recombinant human HDAC-8 expressed in HEK293-F cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. | ChEMBL | |
| Sf9 | Function assay | 2 hrs | Inhibition of recombinant human HDAC-1 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. | ChEMBL | |
| HepG2 | Antimalarial assay | Antimalarial activity against exo-erythrocytic form of Plasmodium berghei infected in human HepG2 cells, IC50 = 0.15 μM. | 24904967 | ||
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生物活性
| 产品描述 | Pracinostat (SB939) 是一种有效的pan-HDAC抑制剂，IC50为40-140 nM，除了HDAC6例外，对III型同工酶SIRT I没有抑制活性。Pracinostat (SB939) induces apoptosis in tumor cells。Phase 2。 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 特性 | SB939是最好的HDAC抑制剂，且是S*BIO Pte 公司的领先候选药。 | |||||||||||
| 靶点 |
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| 体外研究(In Vitro) | ||||
| 体外研究活性 | SB939作用于III型同工酶SIRT I没有抑制效果。与作用于结肠和前列腺癌细胞系相比，SB939作用于皮肤T细胞淋巴癌细胞和白血病细胞效果更好, IC50为50 nM (H9皮肤T细胞淋巴癌细胞)到170 nM (HEL92.1.7红白血病细胞)。SB939浓度为100 μM对正常人类皮肤成纤维细胞也没有抑制效果。SB939作用于HCT-116细胞，诱导组蛋白H3乙酰化, α-tubulin的乙酰化作用, 降低视网膜神经胶质瘤在丝氨酸807/811位点磷酸化，且诱导细胞周期停滞。[1] |
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|---|---|---|---|---|
| 激酶实验 | HDAC酶实验 | |||
| 用于体外研究，SB939溶于DMSO (储存浓度为10 mM)。HDAC 酶实验：I, II，和IV型同工酶实验在384孔板上进行，使用荧光HDAC活性实验。反应液包括2.5或5 μL HDAC同工酶,实验buffer (25 mM Tris-HCl, pH 为7.5; 137 mM NaCl; 2.7 mM KCl, 1 mM MgCl2，和1 mg/mL BSA), 不同浓度的SB939或DMSO,及荧光脱乙酰基酶底物 Flour de LysTM ，全部反应体积为33 μL。实验中使用的同工酶不同，则底物浓度也不同(HDAC1为1μM，HDACs 2-5为250 μM，HDAC6为50 μM, HDACs 7-10为625 μM)。在室温下温育2小时，加入16 μL Flour de LysTM 显影剂，获得荧光团，而得到乙酰基酶底物。 再次温育10分钟后，使用微型板读数器在460nm处测定发射光值。使用Xlfit软件测定IC50值，使用Cheng-Prusoff 公式: IC50/(1+[底物浓度]/Km)计算Ki值 | ||||
| 细胞实验 | 细胞系 | Colo205, HCT-116, A2780, PC3, A2780, DU145, MCF7, BT549, MDA-MB231, T47D, NHI-H460, A549等等。 | ||
| 浓度 | 1.5 nM 到100 μM. | |||
| 孵育时间 | 96小时 | |||
| 方法 | 细胞接种在96孔板上，黏着细胞搁置24小时，悬浮细胞搁置2小时，然后加入SB939处理。加入1% 溶剂进行实验,实验持续96小时。根据说明书，针对黏着细胞使用CyQUANT 细胞增殖实验试剂，针对悬浮细胞使用CellTiter96 Aqueous细胞增殖试剂盒，加入浓度为100 μM到1.5 nM.的SB939，全部体积为100 μL。使用XLfit软件测定IC50值。 |
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| 实验图片 | 检测方法 | 检测指标 | 实验图片 | PMID |
| Western blot | p-JAK2 / JAK2 / p-STAT5 / STAT5 / p-FLT3 / FLT3 |
|
22829971 | |
| 体内研究(In Vivo) | ||
| 体内研究活性 | SB939作用于裸鼠，比SAHA具有更强的药物动力学效果和口服生物有效性。SB939按50 mg/kg剂量处理HCT-116移植瘤，选择性刺激肿瘤组织生长。SB939按100 mg/kg剂量处理携带HCT-116肿瘤的鼠，肿瘤生长抑制率达94%。SB939作用于APCmin鼠，抑制腺瘤形成和提高血球密度，效果比5-氟尿嘧啶好。[1] SB939 作用于肿瘤模型(HCT-116, PC-3, A2780, MV4-11, Ramos)，具有抗癌活性和高效性。SB939具有较好的吸收, 分配, 代谢, 和分泌等药物属性，且安全。[2] |
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|---|---|---|
| 动物实验 | Animal Models | 携带HCT-116移植瘤模型的雌性BALB/c 裸鼠 |
| Dosages | 25, 50, 75, 或100 mg/kg. | |
| Administration | 口服饲喂或者静脉注射处理 | |
| NCT Number | Recruitment | Conditions | Sponsor/Collaborators | Start Date | Phases |
|---|---|---|---|---|---|
| NCT02118909 | Completed | Healthy Volunteers|Non-smokers |
Helsinn Healthcare SA |
May 2014 | Phase 1 |
| NCT02058784 | Completed | Healthy Volunteers|Moderate to Heavy Smokers|Non-smokers |
Helsinn Healthcare SA|Celerion |
February 2014 | Early Phase 1 |
| NCT01112384 | Completed | Metastatic Sarcoma |
NCIC Clinical Trials Group|S*BIO|Canadian Cancer Trials Group |
October 21 2010 | Phase 2 |
| NCT00741234 | Completed | Solid Tumors|Hematologic Malignancies|Myelodysplastic Syndrome |
S*BIO |
April 2007 | Phase 1 |
化学信息&溶解度
| 分子量 | 358.48 | 分子式 | C20H30N4O2 |
| CAS号 | 929016-96-6 | SDF | Download Pracinostat (SB939) SDF |
| Smiles | CCCCC1=NC2=C(N1CCN(CC)CC)C=CC(=C2)C=CC(=O)NO | ||
| 储存条件(自收到货起) | |||
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体外溶解度 |
DMSO : 72 mg/mL ( (200.84 mM) ；DMSO吸湿会降低化合物溶解度，请使用新开封DMSO) Ethanol : 27 mg/mL (75.31 mM) Water : Insoluble |
摩尔浓度计算器 |
|
体内溶解度 现配现用，请按从左到右的顺序依次添加，澄清后再加入下一溶剂 |
动物体内配方计算器 | ||||
实验计算
动物体内配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
mg/kg
g
μL
只
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶于水的药物；不同批次药物配方比例不同，请联系Selleck为您提供正确的澄清溶液配方）
% DMSO
%
% Tween 80
% ddH2O
%DMSO
%
计算结果：
工作液浓度： mg/ml；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于μL DMSO溶液（母液浓度mg/mL，注：如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请先联系Selleck）；
体内配方配制方法：取μL DMSO母液，加入μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入μL ddH2O，混匀澄清。
体内配方配制方法：取μL DMSO母液，加入μL Corn oil，混匀澄清。
注意：1. 首先保证母液是澄清的；
2.一定要按照顺序依次将溶剂加入，进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液，可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。
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