Tubacin

Tubacin 是一种高度有效的选择性的,可逆的,细胞渗透性HDAC6抑制剂,无细胞试验中IC50为4 nM,比作用于HDAC1的选择性高350倍。Tubacin 可通过减少病毒RNA合成来抑制乙型脑炎病毒的复制。

Tubacin Chemical Structure

Tubacin Chemical Structure

CAS: 537049-40-4

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细胞实验数据示例

细胞系 实验类型 给药浓度 孵育时间 活性描述 文献信息
HeLa Function assay 6 hrs Inhibition of HDAC6 in human HeLa cells assessed as reduction in K40 hyperacetylation of alpha-tubulin incubated for 6 hrs by immunofluorescence assay, IC50=2.9μM 25454270
A549 Function assay 20 hrs Inhibition of HDAC-6 in human A549 cells assessed as induction of alpha-tubulin acetylation after 20 hrs by cytoblot analysis, EC50=2.5μM ChEMBL
RAW264.7 Function assay Protection against Bacillus anthracis protective antigen and lethal toxin-diphtheria toxin chimeric protein mediated cytotoxicity in mouse RAW264.7 cells assessed as cell viability 16408003
T24 Function assay Induction of histone H3 acetylation in human T24 cells, EC50=2.9μM 19111466
mammalian cells Function assay Tested for inhibition of Histone deacetylase 6 induced acetylated tubulin in mammalian cells, EC50=2.9μM 14584932
CHO Function assay Inhibition of Bacillus anthracis anthrax protective antigen heptamer pre-pore to pore conversion in CMG2-expressing CHO cells 23964961
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh18 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh30 cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
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生物活性

产品描述 Tubacin 是一种高度有效的选择性的,可逆的,细胞渗透性HDAC6抑制剂,无细胞试验中IC50为4 nM,比作用于HDAC1的选择性高350倍。Tubacin 可通过减少病毒RNA合成来抑制乙型脑炎病毒的复制。
特性 第一个已知的选择性α-微管蛋白脱乙酰基抑制剂。
靶点
HDAC6 [1]
(Cell-free assay)
4 nM
体外研究(In Vitro)
体外研究活性

在A549细胞中,Tubacin增加α微管蛋白乙酰化,而不直接稳定微管,EC50 是2.5 μM。Tubacin抑制HDAC6介导的α-微管蛋白去乙酰化,并抑制野生型和HDAC6过表细胞的迁移。[2]Tubacin联合使用显著增加微管蛋白乙酰化。[3]Tubacin显著抑制药物敏感和耐药的MM细胞的生长,IC50 是 5–20 μM,并且通过激活caspases诱导细胞凋亡。[4]

激酶实验 酶抑制试验
酶抑制实验通过Reaction Biology HDAC Spectrum平台进行。HDAC1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 和 11的测试用离体重组的人类蛋白,HDAC3/NcoR2 复合体用于HDAC3实验。HDAC1, 2, 3, 6, 10, 和11的底物是来自P53残基379-382 (RHKKAc)的荧光肽;HDAC8的底物是基于p53 (RHKAcKAc)残基379-382的荧光二肽。Acetyl-Lys(三氟乙酰)-AMC作为实验HDAC4, 5, 7,和 9的底物。化合物溶于DMSO,以30 μM为初始浓度,3倍连续稀释,测定10个剂量的IC50。对照化合物Trichostatin A (TSA)初始浓度为5uM,3倍连续稀释,测定10个剂量的IC50。IC50值通过计算剂量反应曲线的斜率得到。
细胞实验 细胞系 药物敏感性(MM.1S, U266, INA-6, 和RPMI8226) 和耐药性(RPMI-LR5 和 RPMI-Dox40) MM 细胞系
浓度 ~20 μM
孵育时间 72小时
方法

对MM细胞生长的抑制作用通过溴化噻唑蓝四氮唑(MTT)染料吸收值测定。所有实验重复4次。

实验图片 检测方法 检测指标 实验图片 PMID
Western blot Acetyl-α-tubulin / α-tubulin / pERK / ERK / p-MLC / MLC 26783207
Immunofluorescence p62 / HDAC6 Phalloidin / MYH9 Acetylated Microtubules / Viral HA 26643866
Growth inhibition assay Cell viability 29845122
体内研究(In Vivo)
体内研究活性

在鸡胚中,Tubacin抑制HDAC6活性而降低人工基底膜/聚酰胺纤维筛孔中新生血管的形成。在angioreactors移植的小鼠模型中,Tubacin也会损坏新血管形成。[5]

动物实验 Animal Models 植入angioreactors的无胸腺裸鼠
Dosages --
Administration Tubacin填满半闭合的angioreactors, 随后植入小鼠体内。

化学信息&溶解度

分子量 721.86 分子式

C41H43N3O7S

CAS号 537049-40-4 SDF --
Smiles C1C(OC(OC1C2=CC=C(C=C2)CO)C3=CC=C(C=C3)NC(=O)CCCCCCC(=O)NO)CSC4=NC(=C(O4)C5=CC=CC=C5)C6=CC=CC=C6
储存条件(自收到货起)

体外溶解度
批次:

DMSO : 100 mg/mL ( (138.53 mM) ;DMSO吸湿会降低化合物溶解度,请使用新开封DMSO)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

摩尔浓度计算器

体内溶解度
批次:

现配现用,请按从左到右的顺序依次添加,澄清后再加入下一溶剂

动物体内配方计算器

实验计算

摩尔浓度计算器

质量 浓度 体积 分子量

动物体内配方计算器(澄清溶液)

第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)

mg/kg g μL

第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶于水的药物;不同批次药物配方比例不同,请联系Selleck为您提供正确的澄清溶液配方)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

计算结果:

工作液浓度: mg/ml;

DMSO母液配制方法: mg 药物溶于μL DMSO溶液(母液浓度mg/mL,:如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请先联系Selleck);

体内配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入μL ddH2O,混匀澄清。

体内配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL Corn oil,混匀澄清。

注意:1. 首先保证母液是澄清的;
2.一定要按照顺序依次将溶剂加入,进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液,可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。

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